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Products明膠酶譜法分析試劑盒操作時(shí)要進(jìn)行哪些優(yōu)化
MMPs幾乎能降解細(xì)胞外基質(zhì)(ECM)中的各種蛋白成分,破壞腫瘤細(xì)胞侵襲的組織學(xué)屏障,在腫瘤侵襲轉(zhuǎn)移中起關(guān)鍵性作用,從而在腫瘤浸潤(rùn)轉(zhuǎn)移中的作用日益受到重視,被認(rèn)為是該過(guò)程中主要的蛋白水解酶。MMPs家族已分離鑒別出26個(gè)成員,編號(hào)分別為MMP1~26。根據(jù)作用底物以及片斷同源性,將MMPs分為6類,為膠原酶、明膠酶、基質(zhì)降解素、基質(zhì)溶解素、furin活化的MMP和其他分泌型MMP。
MMP-2基因位于人類染色體16q21,由13個(gè)外顯子和12個(gè)內(nèi)含子所組成,結(jié)構(gòu)基因總長(zhǎng)度為27kb,與其他金屬蛋白酶不同,MMP-2基因5’旁側(cè)序列促進(jìn)子區(qū)域含有2個(gè)GC盒而不是TATA盒?;罨腗MP-2定位于細(xì)胞穿透基質(zhì)的突出部位,估計(jì)其在酶解細(xì)胞間基質(zhì)成分及基底膜的主要成分Ⅳ型膠原中有“鉆頭"的作用。
很多老師出現(xiàn)實(shí)驗(yàn)做不出來(lái),那我我們針對(duì)一些常規(guī)問(wèn)題,做出以下總結(jié),希望實(shí)驗(yàn)中可以幫老師在解決一些問(wèn)題。
1.分離膠一般是8-10% 濃縮膠一般是4%或者5% 如果幾次做不好 配膠可以調(diào)一下 配膠注意的是要 搖勻 加入APS和TEMED后搖晃一下 在配膠板中均勻加入 。
2.每一塊小膠電流為20 mA/gel 如果您跑2塊 增加到30mA左右 膠的數(shù)量增加 電流也需要增加 一般需要跑3-6小時(shí) 電泳要慢慢跑 慢慢壓 復(fù)性時(shí)間可以延長(zhǎng),特別是膠厚度大于0.75mm,保證盡量充分將SDS交換出來(lái)
3. A液和B液孵育時(shí)間要長(zhǎng) Buffer B為37℃搖床孵育
4.不要全部把substrate G反復(fù)凍融 常溫熔化和加熱 底物G 融化后取所需量加熱就可以了 10倍稀釋 比如分離膠體積是360ul,向里加入40ul的底物原液就可以 樣本濃度低 可以上樣15ul到20ul 不能超過(guò)20ul
5. 考馬斯亮藍(lán)染色后 脫色時(shí)候 要邊觀察邊脫色 15分鐘觀察一下 防止脫色太厲害,看不出來(lái)
其他操作注意事項(xiàng):
1.制備聚丙烯酰胺時(shí)應(yīng)注意排除氣泡。
2.明膠酶譜的活性受鈣離子,鋅離子,和PH值等因素的影響,因此緩沖液配制應(yīng)嚴(yán)格準(zhǔn)確,盡量用超純水,孵育溫度也掌握好。
3.用大梳子
4.孵育液的PH好在7.5-7.6,復(fù)性的TRITON時(shí)間長(zhǎng)了會(huì)有絮狀物,所以實(shí)驗(yàn)時(shí)盡量使用新鮮配置的。
5.孵育的37度不要在CO2培養(yǎng)箱中,因?yàn)闀?huì)改變孵育液的PH值,在普通孵箱即可。
6、組織或者細(xì)胞的話可以用PBS,可以用低滲溶液如三分之一或者四分之一的生理鹽水按照5倍體積加入后震蕩裂解細(xì)胞,離心即可,步驟和提蛋白很相似即可,其實(shí)重點(diǎn)的步驟主要是采用低滲裂解液進(jìn)行裂解,組織的話可以勻漿20-30次,然后10000轉(zhuǎn)左右離心,5分鐘取上清即可
另外這個(gè)實(shí)驗(yàn)對(duì)內(nèi)參定量沒(méi)有特別要求需要做
①、至于WB檢測(cè)有條帶,明膠酶譜檢測(cè)沒(méi)有條帶是這樣的,這兩種檢測(cè)方法原理都不相同。一個(gè)是檢測(cè)變性條件下解離的多肽,一個(gè)是活性檢測(cè)。不是說(shuō)一個(gè)有條帶另一個(gè)一定能檢測(cè)出的。
②、關(guān)于出現(xiàn)其他條帶,近我們也研究了,有2個(gè)解釋:一個(gè)就是之前說(shuō)的酶家族其他成員,另一就是酶的降解產(chǎn)物。